Salah satu program Dinas Pendidikan, Kepemudaan dan Olahraga (DPKO) Kabupaten Sumba Barat, yaitu “Green School”. Program ini menjadi selaras dengan tujuan SMP Negeri 3 Waikabubak yang ingin menjadi Sekolah Adiwiyata, yakni Sekolah yang peduli dan berbudaya lingkungan serta memiliki program nyata untuk mengintegrasikan pelestarian lingkungan dalam kegiatan belajar dan mengajar.
Adapun lahan yang disiapkan untuk mensukseskan program ini terletak di bagian belakang Sekolah dan dibagi menjadi 18 bedeng, sesuai dengan jumlah rombel yang ada di SMP Negeri 3 Waikabubak. Bedeng ini nantinya akan ditanami beberapa tanaman seperti lombok, tomat dan lain sebagainya, sehingga hasilnya dapat dimanfaatkan sesuai kebutuhan Sekolah dan juga peserta didik. Dengan program ini, diharapkan dapat menumbuhkan rasa cinta dan peduli terhadap lingkungan serta memberikan edukasi kepada seluruh peserta didik agar mampu mengenali, memanfaatkan dan mengelola lingkungan secara lebih baik guna memperluas pengetahuan peserta didik.
